Implementácia kybernetickej bezpečnosti prebieha v niekoľkých na seba nadväzujúcich krokoch. Ako prvé je potrebné vykonať vlastný audit prostredia, analyzovať spracovateľské činnosti a nájsť kritické miesta. Nasleduje prijatie potrebných technických a personálnych opatrení. Zároveň je nevyhnutné celý proces zmapovať v bezpečnostnej dokumentácii. Ak je organizácia prevádzkovateľom základnej služby v zmysle zákona o kybernetickej bezpečnosti, je potrebné, aby sa organizácia v ďalšom kroku podrobila auditu, ktorý vykoná certifikovaný audítor. Následne je nevyhnutné dodržiavať (a neustále zlepšovať) prijaté bezpečnostné opatrenia.